白癜风是否可以植皮 http://pf.39.net/bdfyy/bdfhl/190329/7007746.html
导读在进行鱼类年龄鉴定的时候，我们通常会用到耳石作为年龄鉴定的材料。耳石是鱼类耳囊内起听觉和平衡作用的钙化组织（主要成分为碳酸钙），耳石上具有中心核，为耳石生长的起点。一般我们可以通过耳石的重量或者轮纹来进行年龄鉴定。大量研究发现，耳石上的年轮和日轮精确地记录了鱼类生活史的进程。因此，通过耳石轮纹来进行鱼类年龄鉴定，可以使得结果更具有说服力。在进行鱼类生长、种群年龄结构调查等相关研究中，年龄鉴定的重要性更是不言而喻。基础知识使用耳石轮纹进行年龄鉴定前，我们需要先将鱼类耳石从鱼类的耳囊中摘取出来，并通过打磨、灼烧或者切割的方式获取耳石轮纹，在此过程中，需要注意获取的耳石轮纹一定要包含耳石的中心核，否者会对年龄鉴定的结果造成影响。以打磨获取的耳石轮纹为例，通常使用打磨方式获得耳石轮纹后，需要在透射光下进行观察，并以明带作为年龄的标志。同时，在进行鱼类生长相关的研究时，我们还需要读取轮纹宽度来获得鱼类生长序列。之前鱼类耳石轮径测量大多采用ImageJ完成，因其耗时费力，后期处理数据繁琐，下面介绍使用R程序包测量耳石轮径并且自动储存读取的数据，R程序包基本信息见下：

R包名称

开发者

最近更新

简介

RFishBC

DerekOgle

.12.11

帮助研究者测量鱼类钙化组织中的数据，并提供算法进行体长退算

MtreeRing

JingningShi,WeiXiang

.10.3

使用边缘探测算法自动生成图片中的年轮宽度序列，并提供手动修改模式

measuRing

WilsonLara,CarlosSierra,FelipeBravo

.2.11

通过图片明带暗带色值差异产生距离矩阵以及时间序列

耳石轮径读取及数据可视化

1.1RFishBC进行耳石轮径半自动测量：

library(RFishBC)library(dplyr)#formutate(),inner_join(),%%#Warning:packagedplyrwasbuiltunderRversion3.6.3setwd(choose.dir())digitizeRadii("Scale_1.jpg",id="1",reading="DHO",edgeIsAnnulus=FALSE)a.导入耳石图片b.设定耳石图像比例尺c.找到耳石核心和边缘

d.识别耳石轮纹并且打点

1.2RFishBC存储耳石轮径测量数据：

#DatafromOneStructure

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